Magister Arsitektur UII akan menghasilkan lulusan yang memiliki keahlian Riset Desain dalam konteks arsitektur, yang merefleksikan ajaran rahmatan lil alamin, yang mencakup nilai-nilai keberlanjutan (sustainability), ketahanan (resilience), kualitas hidup (quality of life), dan kemanusiaan (humanity). Untuk mencapai tujuan tersebut mahasiswa akan dibekali kemampuan untuk berpikir kritis (critical thinking), bersikap sensitif terhadap konteks (contextual sensitivity), dan menghasilkan rancangan lingkungan binaan (built environment) yang solutif.